Bem vindo
O Laboratório de Bioinformática é vinculado ao Departamento de Microbiologia e Parasitologia (MIP) do Centro de Ciências Biológicas (CCB) da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) e tem por objetivos:
- A análise de sequências nucleotídicas e protéicas;
- O desenvolvimento e/ou melhoramento de softwares para análise de sequências de nucleotédeos e de proteínas;
- O oferecimento de ferramentas de bioinformática á comunidade científica;
- O treinamento e a formação de recursos humanos.
O laboratório está¡ envolvido na Rede Nacional de Sequênciamento de DNA (Projeto Genoma Nacional) e outros projetos Genoma Regionais (Genopar, PIGS e ShEST), apoiados pelo CNPq/MCT, Fapergs, Genopar e Fapesc. Está registrado junto ao diretório de Grupos do CNPq e na Bioinformatics Network for Latin-America and Caribbean (LacBionet) e desenvolve pesquisas em colaboração com o Instituto Oswaldo Cruz (Fiocruz) e outras instituições de ensino e pesquisa no Brasil.
O nosso laboratório conta com o apoio do Núcleo de Processamento de Dados (NPD) da Universidade Federal de Santa Catarina, onde esão alocados os nossos servidores, tanto de processamento de dados quanto o servidor WEB. O NPD conta com uma infraestrutura que garante que nossos serviços estejam disponiveis 24 horas por dia.
Sistema de análise de sequências de nucleotídeos e proteínas, desenvolvido em parceria com o Laboratório de Biologia Computacional e de Sistemas do IOC/FICRUZ. Este sistema foi implementado utilizando linguagem PERL e agrega mais de 25 programas de análise de sequencias em um único pipeline. |
Congrega pesquisadores de diferentes instituições de ensino e/ou pesquisa com objetivo da identificação e caracterização de marcadores biológicos e diagnósticos em tripanosomatídeos patogênicos através de genômica e proteômica comparativas.
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ProtozoaDB is being developed to host both genomics and post-genomics data from Protozoan species (Kinetoplastida and Apicomplexa). ProtozoaDB is using the Genomics Unified Schema on top of PostGRES open-source relational database system. This database complements related databases by providing further analyses with emphasis on (a) distant similarities (HMM-based), (b) phylogeny-based annotations including orthology analysis, and (c) druggability. |
A Rede de Proteoma do Estado de Santa Catarina (RPSC) foi criada em 2005 como parte integrante da Rede Proteoma Nacional. Visa inicialmente o estudo do proteoma do M. hyopneumoniae em colaboração com a Rede de Proteoma do Rio Grande do Sul e com o Programa de Investigação de Genomas Sul - PIGS. |
O Consórcio BiowebDB foi criado em 2003 e fundado em 2004 através de financiando do CNPq. Este consórcio envolve diversos centros de pesquisa e universidades do Brasil e caracteiza-se por ser uma plataforma multi-usuário de genômica comparativa. Esta plataforma está fisicamente hospedada na Fundação Oswaldo Cruz no Rio de Janeiro e com mirror na UFSC |
Este sistem foi desenvolvido com o intuito de otimizar a busca de sequencias proteicas de toxinas Clostridium butolinum depositadas no GenBank (NCBI) e atribuir automaticamente os sorotipe e subtipo de cada sequencia. Este sistema foi desenvolvido a pedido do Dr. Hercules Moura (CDC/CCEHIP/NCEH). O sistema ainda está em fase de implementação (Versão 0.8) |
As pessoas nÃo sabem o que querem atÉ vocÊ mostrar a elas. (Steve Jobs)
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